Mts Muhammadiyah 06 Sambi memiliki gedung dengan 2 lantai dan 5 tingkatan kelas terdiri dari kelas VII, kelas VIII A dan VIII B, kelas IX A dan IX B dengan 8 ruang kelas, 1 laboratorium komputer, 1 ruang tata usaha, 1 ruang guru dan 1 ruang kepala sekolah